En la mayora de casos, los dolores de cabeza vinculados a la menstruacin se desencadenan a consecuencia de los cambios hormonales que particularmente ocurren durante los das previos al ciclo menstrual, cuando los niveles de estrgeno descienden de forma rpida. Las prostaglandinas, o sustancias qumicas producidas naturalmente por el revestimiento uterino, tambin desempean una funcin en los dolores de cabeza.