Aunque BitLocker garantiza el cifrado de todos los datos en todo el volumen del sistema, EFS tiene la ventaja de ser ms preciso y flexible a la hora de configurar el cifrado para uno o varios usuarios de un equipo. Por ejemplo, EFS se puede usar para cifrar archivos de datos en una red a la que tienen acceso muchos usuarios distintos, un escenario que supera la capacidad de BitLocker.